石磨面粉和普通机磨面粉相比，在很多方面都具有很大的优势。从加工工艺来看，普通机磨面粉所使用的磨粉机运转速度快，加工温度高，对一些像蛋白质、热敏性维生素等营养物质有很大的影响;而石磨采用低转速、低温度加工方式，减少了营养素的流失，而且还可以保留麦子独特的香味。

    从营养价值上来看，石磨面粉机大多都是全麦粉，包含小麦的全部营养成分，其中的B族维生素、矿物质和膳食纤维都是比较丰富的，特别是维生素B1，它主要存在于谷物当中的谷皮和糊粉层中，而机磨面粉由于速度过快，对B1造成的损失较大。